Pemburu Varian: Di Dalam Upaya Afrika Selatan untuk Menghentikan Mutasi Berbahaya
Health

Pemburu Varian: Di Dalam Upaya Afrika Selatan untuk Menghentikan Mutasi Berbahaya

NTUZUMA, Afrika Selatan — Beberapa bulan yang lalu, Sizakele Mathe, seorang pekerja kesehatan masyarakat di kotapraja lereng bukit yang luas di tepi kota Durban, diberitahu oleh sebuah klinik bahwa seorang tetangga telah berhenti mengambil obatnya. Itu adalah tanda peringatan bahwa dia kemungkinan besar telah berhenti memakai tablet antiretroviral yang menekan infeksi HIV-nya.

Itu adalah ancaman bagi kesehatannya sendiri — dan, di era Covid-19, itu mungkin menimbulkan risiko bagi orang lain. Klinik mengirim Ms. Mathe untuk mendaki bukit, menyusuri jalan sempit dan mencoba membuat wanita itu kembali meminum pil.

Ms. Mathe, yang ceria dan tak kenal lelah, adalah bagian dari kampanye omelan dari rumah ke rumah secara nasional. Ini adalah setengah dari upaya Afrika Selatan yang canggih untuk menghentikan kemunculan varian baru virus corona, seperti jenis Omicron yang diidentifikasi di sini dan mengguncang dunia minggu lalu.

Setengah lainnya terjadi di laboratorium canggih 25 mil di jalan. Di KwaZulu-Natal Research Innovation and Sequencing Platform di Durban, para ilmuwan mengurutkan genom dari ribuan sampel virus corona setiap minggu. Lab KRISP, sebagaimana diketahui, adalah bagian dari jaringan peneliti virus nasional yang mengidentifikasi varian Beta dan Omicron, memanfaatkan keahlian yang dikembangkan di sini selama puluhan tahun berjuang melawan HIV di kawasan ini.

Kombinasi teknologi tinggi dan akar rumput ini mewakili salah satu garis depan dalam pertempuran dunia melawan virus corona yang terus berkembang. Pada hari Jumat, jaringan penelitian di Afrika Selatan melaporkan kepada dunia yang menunggu dengan cemas informasi baru bahwa varian baru tampaknya menyebar dua kali lebih cepat dari Delta, yang dianggap sebagai versi virus yang paling menular.

Para peneliti di KRISP adalah pemimpin global dalam filogenetik virus, studi tentang hubungan evolusioner antara virus. Mereka melacak mutasi pada virus corona, mengidentifikasi hot spot penularan dan memberikan data penting tentang siapa yang menginfeksi siapa – yang mereka simpulkan dengan melacak mutasi pada virus di seluruh sampel – untuk membantu mengurangi penyebaran.

Sejak awal pandemi, mereka telah mengamati dengan cermat bagaimana virus berubah di Afrika Selatan karena mereka mengkhawatirkan satu hal khususnya: delapan juta orang di negara itu (13 persen dari populasi) yang hidup dengan HIV.

Ketika orang dengan HIV diberi resep antiretroviral yang efektif dan meminumnya secara konsisten, tubuh mereka hampir sepenuhnya menekan virus. Tetapi jika orang dengan HIV tidak terdiagnosis, belum diberi resep pengobatan, atau tidak, atau tidak dapat, meminum obat mereka secara konsisten setiap hari, HIV melemahkan sistem kekebalan mereka. Dan kemudian, jika mereka tertular virus corona, diperlukan waktu berminggu-minggu atau berbulan-bulan sebelum virus baru itu dibersihkan dari tubuh mereka.

Ketika coronavirus hidup selama itu di sistem mereka, ia memiliki kesempatan untuk bermutasi dan bermutasi dan bermutasi lagi. Dan, jika mereka menyebarkan virus yang bermutasi, varian baru sedang beredar.

“Kami memiliki alasan untuk percaya bahwa beberapa varian yang muncul di Afrika Selatan berpotensi terkait langsung dengan HIV,” kata Tulio de Oliveira, peneliti utama dari jaringan pemantauan genetik nasional.

Pada hari-hari pertama pandemi, otoritas kesehatan Afrika Selatan bersiap menghadapi melonjaknya tingkat kematian orang dengan HIV “Kami pada dasarnya menciptakan skenario horor bahwa Afrika akan hancur,” kata Salim Abdool Karim, ahli epidemiologi yang mengepalai lembaga AIDS. dimana KRISP bertempat. “Tapi tidak ada yang berhasil.” Alasan utamanya adalah HIV paling umum di kalangan anak muda, sedangkan virus corona paling parah menyerang orang tua.

Infeksi HIV membuat seseorang sekitar 1,7 kali lebih mungkin meninggal karena Covid – peningkatan risiko, tetapi tidak ada artinya dibandingkan dengan risiko orang dengan diabetes, yang 30 kali lebih mungkin meninggal. “Begitu kami menyadari bahwa inilah situasinya, kami kemudian mulai memahami bahwa masalah nyata kami dengan HIV di tengah Covid adalah prospek bahwa orang dengan sistem kekebalan yang parah akan mengarah pada varian baru,” kata Dr. Abdool Karim.

Para peneliti di KRISP telah menunjukkan bahwa ini telah terjadi setidaknya dua kali. Tahun lalu, mereka melacak sampel virus ke seorang wanita berusia 36 tahun dengan HIV yang menggunakan rejimen pengobatan yang tidak efektif dan yang tidak dibantu untuk menemukan obat yang dapat dia toleransi. Dia membutuhkan waktu 216 hari untuk membersihkan virus corona dari sistemnya; dalam waktu itu di dalam tubuhnya, virus memperoleh 32 mutasi yang berbeda.

Pada bulan November, Dr. de Oliveira dan timnya melacak sampel virus corona dengan lusinan mutasi ke bagian lain negara itu, Western Cape, di mana pasien lain juga tidak mematuhi rejimen obat HIV. Virus corona bertahan di tubuhnya selama berbulan-bulan dan menghasilkan puluhan mutasi. Ketika para wanita ini diberi resep obat yang efektif dan diberi nasihat tentang cara meminumnya dengan benar, mereka membersihkan virus dengan cepat.

“Kami tidak memiliki banyak orang seperti dia,” kata Dr. Abdool Karim tentang wanita yang membutuhkan waktu 216 hari untuk membersihkan virus corona dari sistem tubuhnya. “Tapi itu tidak membutuhkan banyak orang, itu hanya membutuhkan satu atau dua.” Dan satu varian dapat mengguncang dunia, seperti yang dimiliki Omicron.

Asal usul varian ini masih belum diketahui. Orang dengan HIV bukan satu-satunya yang sistemnya dapat secara tidak sengaja memberi virus corona kesempatan untuk bermutasi: Itu bisa terjadi pada siapa saja yang mengalami gangguan kekebalan, seperti pasien transplantasi dan mereka yang menjalani perawatan kanker.

Pada saat tim KRISP mengidentifikasi kasus kedua orang dengan HIV yang memproduksi varian virus corona, ada lebih dari selusin laporan tentang fenomena yang sama dalam literatur medis dari bagian lain dunia.

Virus juga bermutasi pada orang dengan sistem kekebalan yang sehat. Perbedaan bagi orang dengan HIV, atau kondisi imunosupresi lainnya, adalah karena virus tetap berada di sistem mereka lebih lama, proses seleksi alam memiliki lebih banyak waktu untuk mendukung mutasi yang menghindari kekebalan. Periode replikasi khas pada orang yang sehat hanya beberapa minggu, bukan berbulan-bulan; lebih sedikit replikasi berarti lebih sedikit peluang untuk mutasi baru.

Dan karena Afrika Selatan memiliki begitu banyak orang dengan HIV, dan karena pandemi baru ini telah melanda dengan keras di sini, mengganggu kehidupan dalam banyak hal, ada urgensi khusus untuk pekerjaan mencoba memblokir varian tersebut.

Di situlah upaya petugas kesehatan masyarakat seperti Ms. Mathe masuk. Pada hari kerja biasa, dia berjalan di jalan tanah melewati pipa bocor dan salon rambut anak tangga depan, dipersenjatai dengan ponsel kuno dan daftar mental siapa yang telah muncul. di klinik akhir-akhir ini, yang terlihat tidak sehat dan yang perlu dikunjungi. Ms. Mathe, yang telah menjalani pengobatan HIV selama 13 tahun, dibayar $150 per bulan.

Silendile Mdunge, seorang ibu kurus berusia 36 tahun dari tiga anak, berhenti memakai antiretroviralnya selama gelombang ketiga brutal Covid yang melanda Afrika Selatan antara Mei dan Juli. Obat-obatannya tidak lagi dikirim ke tempat penjemputan komunitas terdekat karena banyak petugas kesehatan yang dipindahkan. Sebaliknya, dia seharusnya mengumpulkan pil di klinik pusat sekitar sembilan mil jauhnya. Tetapi dia takut tertular virus baru ini di taksi bersama atau berdiri di antrean klinik besar yang dia dengar.

Dia berhenti minum obat selama empat bulan sebelum Ms. Mathe muncul di rumah kecil yang dibangun dari kayu bekas yang digunakan bersama oleh Mdunge dengan tujuh anggota keluarga.

“Dia mengatakan kepada saya bahwa orang-orang yang gagal dalam perawatan mereka tidak lagi hidup, dia mengatakan kepada saya bahwa saya harus memikirkan anak-anak saya, dia bilang saya bisa mati,” kata Mdunge, bersandar di kusen pintu yang kasar di tengah hujan ringan yang hangat. . Itu adalah hal-hal yang sudah dia ketahui, secara abstrak.

Namun kehadiran Ms. Mathe yang gigih membuat peringatan tersebut sulit untuk diabaikan. Dengan mengangkat bahu dan memutar mata, Mdunge menyarankan agar dia memulai kembali perawatan untuk mengakhiri gangguan sebanyak yang lainnya.

Ms. Mathe mendengarkan cerita ulang metodenya ini sambil tersenyum. “Jika Anda tidak memiliki cinta untuk orang lain, Anda tidak akan melakukan pekerjaan ini,” katanya

Dari delapan juta orang Afrika Selatan dengan HIV, 5,2 juta sedang dalam pengobatan — tetapi hanya dua pertiga dari kelompok itu yang berhasil menekan virus dengan pengobatan. Masalahnya meluas di luar perbatasan Afrika Selatan: 25 juta orang hidup dengan virus di seluruh Afrika sub-Sahara, di antaranya 17 juta di antaranya ditekan secara viral dengan pengobatan.

Laboratorium KRISP sedang mengurutkan sampel virus corona dari seluruh Afrika, untuk mengisi beberapa celah bagi negara-negara yang tidak memiliki kapasitas sendiri untuk melakukannya. Jaringan pengawasan dan pengurutan genom Afrika Selatan cukup komprehensif sehingga para penelitinya mungkin menjadi yang pertama mendeteksi bahkan kasus yang tidak berasal dari negara tersebut.

Ketakutan besar adalah varian dengan “kekebalan melarikan diri”: kemampuan untuk menghindari vaksin Covid atau respon imun yang ditimbulkan oleh infeksi sebelumnya. Karena semakin banyak orang di Afrika Selatan yang divaksinasi terhadap Covid, ada potensi varian yang muncul di tubuh orang yang divaksinasi.

“Anda memiliki situasi di mana Anda memiliki potensi untuk menciptakan varian yang sangat buruk,” kata Dr. Abdool Karim, yang telah membantu memimpin respons Covid Afrika Selatan. Varian sebelumnya muncul ketika hanya sedikit orang yang memiliki akses ke vaksinasi, tetapi sekarang Afrika Selatan telah mengirimkan suntikan ke lebih dari sepertiga warganya. Jika orang dengan HIV yang divaksinasi tidak memiliki atau tidak memakai antiretroviral mereka, mungkin ada peluang bagi virus untuk bermutasi untuk menghindari vaksin.

“Sekarang, banyak dari pasien HIV ini telah divaksinasi sehingga mereka memiliki tanggapan kekebalan mereka. Jadi, jika mereka ingin menghasilkan varian baru, varian itu harus lolos dari respons imun tersebut,” kata Dr. Abdool Karim.

Dr. de Oliveira mengatakan dia tidak terlalu khawatir tentang varian yang resistan terhadap vaksin yang muncul di Afrika Selatan daripada, misalnya, kantong Amerika Serikat dengan HIV yang tidak diobati, cakupan vaksinasi yang rendah dan jaringan pengawasan yang lebih lemah daripada yang dimiliki Afrika Selatan.

“Kemungkinan kita akan menemukannya lebih dulu,” katanya sambil tertawa muram.

Perbedaan dengan risiko mutasi virus pada orang dengan HIV yang tidak terkontrol, ia menunjukkan, adalah bahwa ini adalah masalah dengan solusi yang siap – membuat semua orang dengan HIV menjalani pengobatan – sedangkan pasien transplantasi atau kanker tidak memiliki pilihan.

Di atas segalanya, jawaban untuk mengakhiri ancaman varian adalah dengan menahan penularan virus corona. “Vaksinasi, vaksinasi, vaksinasi penduduk Afrika,” katanya. “Kekhawatiran saya adalah nasionalisme vaksin atau penimbunan vaksin.” Orang dengan HIV harus diprioritaskan untuk booster vaksin, untuk memaksimalkan efektivitas tanggapan kekebalan mereka, tambahnya.

Sejauh ini, upaya Afrika Selatan untuk mengatasi masalah varian, dan bersikap transparan tentang hal itu, harus dibayar mahal, dalam bentuk larangan terbang dan isolasi global.

“Sebagai ilmuwan, terutama yang berada di garis depan, kami berdebat untuk mengecilkan masalah HIV,” Dr. de Oliveira merenung di labnya minggu lalu. “Jika kami sangat vokal, kami juga mengambil risiko, sekali lagi, diskriminasi besar dan penutupan perbatasan dan langkah-langkah ekonomi. Tetapi, jika Anda tidak terlalu vokal, kami memiliki kematian yang tidak perlu.”

Carl Zimmer pelaporan kontribusi.

Posted By : togel hongkonģ